More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0550 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  100 
 
 
509 aa  1024    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  72.32 
 
 
469 aa  547  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  54.57 
 
 
451 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  55.19 
 
 
451 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  56.93 
 
 
444 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  52.49 
 
 
451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 
905 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  36.43 
 
 
428 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  34.61 
 
 
424 aa  229  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 
430 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 
438 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  47.03 
 
 
495 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 
465 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 
487 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  49.72 
 
 
553 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.62 
 
 
841 aa  187  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  48.62 
 
 
836 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  48.62 
 
 
792 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  47.28 
 
 
481 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  47.78 
 
 
407 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  48.33 
 
 
632 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  48.09 
 
 
339 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 
428 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  42.23 
 
 
618 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  42.23 
 
 
876 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  48.07 
 
 
387 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  46.37 
 
 
371 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  39.8 
 
 
648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  49.17 
 
 
718 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
719 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.86 
 
 
343 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  48.02 
 
 
574 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.4 
 
 
496 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 
518 aa  171  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  45.95 
 
 
1171 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 
1073 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 
339 aa  171  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  45.81 
 
 
550 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
545 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  49.08 
 
 
736 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
463 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 
698 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.51 
 
 
860 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.51 
 
 
880 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 
718 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
770 aa  167  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  45.4 
 
 
505 aa  167  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  43.93 
 
 
548 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  44.21 
 
 
357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 
331 aa  166  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.99 
 
 
491 aa  166  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  37.35 
 
 
374 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  44.13 
 
 
713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2094  response regulator  43.52 
 
 
329 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.68 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.68 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 
357 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 
526 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  44.85 
 
 
650 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  47.75 
 
 
565 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  38.66 
 
 
563 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  47.19 
 
 
562 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 
345 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
177 aa  164  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 
508 aa  163  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  45.4 
 
 
334 aa  163  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 
345 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 
357 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  40.22 
 
 
471 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 
248 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  41.12 
 
 
320 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
247 aa  162  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
452 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  41.62 
 
 
377 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  41.62 
 
 
373 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  41.62 
 
 
373 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  41.62 
 
 
377 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  41.62 
 
 
374 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  43.06 
 
 
311 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
499 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.98 
 
 
487 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  39.25 
 
 
453 aa  160  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
462 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 
498 aa  160  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.4 
 
 
334 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  38.3 
 
 
564 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  42.93 
 
 
347 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.15 
 
 
389 aa  159  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  44.25 
 
 
334 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  44.57 
 
 
848 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  45.98 
 
 
740 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  37.43 
 
 
363 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  42.55 
 
 
712 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  44.86 
 
 
1333 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
547 aa  158  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>