More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0725 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 498 aa  1001    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  61.65 
 
 		 506 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.47 
 
 		 496 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 513 aa  210  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.02 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.49 
 
 		 487 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  42.64 
 
 		 632 aa  199  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.22 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  41.81 
 
 		 553 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  42.45 
 
 		 550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  45.96 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  41.8 
 
 		 561 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  48.19 
 
 		 618 aa  183  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 		 547 aa  183  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 		 547 aa  183  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 526 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.76 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  39.92 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  46.99 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 		 212 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 718 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  44.68 
 
 		 451 aa  177  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 		 719 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  40.18 
 
 		 619 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  46.23 
 
 		 499 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 		 357 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  45.65 
 
 		 339 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.12 
 
 		 331 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  42.38 
 
 		 792 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 615 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 		 387 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.35 
 
 		 331 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  43.24 
 
 		 465 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.9 
 
 		 841 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 		 718 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 692 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  42.21 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  43.39 
 
 		 314 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  44.62 
 
 		 481 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.36 
 
 		 502 aa  170  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  31.83 
 
 		 392 aa  170  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 		 713 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 860 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  37.44 
 
 		 611 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.25 
 
 		 880 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 		 710 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 		 298 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  42.01 
 
 		 571 aa  168  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  44.56 
 
 		 698 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  43.22 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3114  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 		 523 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00390297  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2209  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 526 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  41.43 
 
 		 836 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  42.02 
 
 		 334 aa  166  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  43.58 
 
 		 334 aa  166  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 		 357 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  46.56 
 
 		 197 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  41.18 
 
 		 311 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  36.76 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2427  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000118537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0215  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 		 536 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 		 703 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 		 703 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2247  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2172  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0465103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  41.85 
 
 		 876 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  44.79 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 		 710 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  45.26 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1789  response regulator receiver protein  29.21 
 
 		 524 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101023  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40.36 
 
 		 712 aa  163  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2212  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 523 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.16257  normal  0.683218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2222  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 523 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.151758  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  42.41 
 
 		 438 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 		 571 aa  163  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  42.78 
 
 		 563 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 		 357 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 		 357 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  37.75 
 
 		 770 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 		 905 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 		 648 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.69 
 
 		 350 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  39.23 
 
 		 317 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.67 
 
 		 1171 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4485  hypothetical protein  27.96 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  27.38 
 
 		 525 aa  160  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  45.51 
 
 		 226 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  42.27 
 
 		 564 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  41.9 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>