More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0573 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
736 aa  1373    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  49.08 
 
 
509 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 
505 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 
758 aa  159  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  43.65 
 
 
339 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 
465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 
451 aa  157  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.48 
 
 
483 aa  156  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  44.17 
 
 
469 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 
320 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  45.76 
 
 
438 aa  154  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.34 
 
 
526 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
177 aa  154  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  34.12 
 
 
618 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  41.18 
 
 
563 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 
320 aa  151  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 
444 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  42.42 
 
 
648 aa  150  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
593 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  40.59 
 
 
564 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
428 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  42.08 
 
 
905 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  45.4 
 
 
719 aa  149  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 
487 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 
343 aa  147  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
357 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
357 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 
451 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  39.43 
 
 
561 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
617 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 
719 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 
615 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
199 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
339 aa  145  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.48 
 
 
357 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
363 aa  144  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  37.89 
 
 
632 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 
374 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 
220 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  44.17 
 
 
481 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
347 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  44.25 
 
 
718 aa  141  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 
407 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 
502 aa  140  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 
495 aa  140  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 
1073 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  40.91 
 
 
836 aa  139  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 
391 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.98 
 
 
841 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  39.88 
 
 
371 aa  138  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
357 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.29 
 
 
550 aa  138  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  38.15 
 
 
374 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  38.15 
 
 
377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  38.15 
 
 
373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  38.15 
 
 
373 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  38.15 
 
 
377 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  38.15 
 
 
374 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 
357 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 
366 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  38.21 
 
 
462 aa  137  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  38.51 
 
 
430 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 
350 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  44.97 
 
 
1333 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.46 
 
 
833 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
623 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  42.01 
 
 
545 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  39.88 
 
 
712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
703 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  41.81 
 
 
306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
651 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.78 
 
 
860 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.78 
 
 
880 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.77 
 
 
348 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
703 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
375 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.24 
 
 
347 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
375 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
553 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
463 aa  134  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  41.62 
 
 
561 aa  134  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
491 aa  134  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1513  metal dependent phosphohydrolase  44.12 
 
 
294 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 
650 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 
451 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
770 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  40.83 
 
 
1335 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
371 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  40.61 
 
 
718 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.31 
 
 
912 aa  132  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 
692 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 
467 aa  132  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  37.7 
 
 
599 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  39.62 
 
 
201 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
647 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  44.59 
 
 
252 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>