More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2187 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
593 aa  1218    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  45.89 
 
 
619 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  58.72 
 
 
912 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  54.25 
 
 
758 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 
483 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  53.8 
 
 
814 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  53.13 
 
 
617 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  41.96 
 
 
836 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  51.43 
 
 
623 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  51.13 
 
 
803 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.96 
 
 
971 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  48.9 
 
 
465 aa  352  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.09 
 
 
853 aa  336  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 
500 aa  334  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  44.65 
 
 
540 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 
719 aa  327  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.35 
 
 
1338 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.19 
 
 
755 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.3 
 
 
681 aa  317  4e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.21 
 
 
520 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 
960 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  45.09 
 
 
599 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
837 aa  299  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.33 
 
 
474 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.33 
 
 
746 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  41.88 
 
 
526 aa  287  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.23 
 
 
434 aa  286  8e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  44.7 
 
 
599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.43 
 
 
539 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
909 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.27 
 
 
833 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1694  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.54 
 
 
579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
1073 aa  236  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  35.95 
 
 
563 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  35.68 
 
 
564 aa  220  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  32.42 
 
 
545 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.96 
 
 
683 aa  204  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  34.44 
 
 
792 aa  203  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  34.72 
 
 
836 aa  203  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.44 
 
 
841 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
608 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
505 aa  189  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
534 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.22 
 
 
1125 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
561 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.82 
 
 
880 aa  165  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.49 
 
 
860 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
199 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 
201 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 
684 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 
465 aa  157  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 
357 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 
487 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
719 aa  154  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 
770 aa  153  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0573  metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
736 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334639  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  48.47 
 
 
651 aa  151  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
652 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  34.73 
 
 
420 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.17 
 
 
503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
207 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.59 
 
 
350 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 
220 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.57 
 
 
348 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
526 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
648 aa  147  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5359  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 
347 aa  147  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  42.94 
 
 
1171 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
350 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 
438 aa  147  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  42.24 
 
 
632 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  41.21 
 
 
308 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 
718 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
320 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 
347 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2492  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
195 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.200844 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
379 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  39.68 
 
 
320 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.28 
 
 
347 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 
1237 aa  145  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
366 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.97 
 
 
348 aa  144  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1789  response regulator receiver protein  37.44 
 
 
524 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0101023  normal  0.210198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
357 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
359 aa  144  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  41.1 
 
 
650 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  37.28 
 
 
334 aa  144  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0327  diguanylate cyclase  43.03 
 
 
295 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  41.57 
 
 
448 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  32.59 
 
 
718 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.45 
 
 
438 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 
502 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  42.68 
 
 
495 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1983  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 
523 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00722808  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  44.44 
 
 
1333 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 
357 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.7 
 
 
394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>