More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0910 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
561 aa  1154    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  53.65 
 
 
550 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  40.83 
 
 
563 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  35.34 
 
 
564 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  37.19 
 
 
545 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 
505 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.24 
 
 
841 aa  281  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  37.7 
 
 
836 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  37.7 
 
 
792 aa  273  7e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.08 
 
 
1073 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.3 
 
 
608 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.58 
 
 
623 aa  220  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.88 
 
 
853 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  36.68 
 
 
599 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 
960 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  32.78 
 
 
836 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.73 
 
 
1125 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 
534 aa  206  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.7 
 
 
520 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 
683 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  35.75 
 
 
599 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.72 
 
 
1338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.06 
 
 
814 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.69 
 
 
483 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
681 aa  193  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.24 
 
 
755 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  32.61 
 
 
619 aa  193  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.21 
 
 
971 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.15 
 
 
684 aa  190  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  32.61 
 
 
526 aa  189  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  35.73 
 
 
803 aa  189  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
719 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.77 
 
 
746 aa  187  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.32 
 
 
465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
833 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 
434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
912 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.31 
 
 
758 aa  180  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
593 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.24 
 
 
328 aa  177  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
617 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.88 
 
 
474 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.26 
 
 
343 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
553 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
500 aa  171  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 
331 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  43.43 
 
 
550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.34 
 
 
837 aa  165  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  41.45 
 
 
710 aa  163  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
331 aa  163  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  46.29 
 
 
481 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 
652 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  36.57 
 
 
339 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 
692 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
548 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  36.28 
 
 
465 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  41.94 
 
 
349 aa  160  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.66 
 
 
513 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 
545 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  29.48 
 
 
540 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
463 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 
363 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
770 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
347 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 
438 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
703 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  39.9 
 
 
407 aa  157  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 
248 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
703 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 
508 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40.3 
 
 
712 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
347 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  40.57 
 
 
226 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
357 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 
320 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  42.68 
 
 
547 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  42.68 
 
 
547 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
448 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.57 
 
 
350 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
229 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  36.6 
 
 
876 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
648 aa  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
331 aa  151  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0663  putative PAS/PAC sensor protein  39.25 
 
 
384 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.306421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 
506 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  40.66 
 
 
387 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  41.11 
 
 
1313 aa  150  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
177 aa  150  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
366 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 
471 aa  150  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  39.44 
 
 
1333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  28.37 
 
 
539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  39.47 
 
 
611 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  38.51 
 
 
650 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
487 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31 
 
 
909 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>