More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0996 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  90.48 
 
 
599 aa  1030    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  100 
 
 
599 aa  1183    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  39.32 
 
 
619 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.33 
 
 
483 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  48.86 
 
 
814 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
912 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  37.71 
 
 
803 aa  336  7e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 
465 aa  332  9e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
617 aa  327  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  42.67 
 
 
836 aa  313  4.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.33 
 
 
853 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 
837 aa  312  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.72 
 
 
1338 aa  310  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.62 
 
 
755 aa  310  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
623 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  35.23 
 
 
526 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 
593 aa  302  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
540 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.23 
 
 
539 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.16 
 
 
971 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.5 
 
 
500 aa  294  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 
960 aa  292  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.73 
 
 
719 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.6 
 
 
434 aa  291  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.89 
 
 
520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 
681 aa  287  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.32 
 
 
746 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
909 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.99 
 
 
758 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.73 
 
 
833 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.06 
 
 
474 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1694  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.19 
 
 
579 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 
1073 aa  256  6e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.04 
 
 
841 aa  242  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  36.31 
 
 
792 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  36.04 
 
 
836 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  37.81 
 
 
563 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  37.81 
 
 
564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 
608 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 
561 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 
545 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
550 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.18 
 
 
1125 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.55 
 
 
505 aa  193  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 
683 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
684 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 
652 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  34.07 
 
 
534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.86 
 
 
860 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.86 
 
 
880 aa  168  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.48 
 
 
496 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.62 
 
 
506 aa  164  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
357 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  44.04 
 
 
615 aa  164  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  42.41 
 
 
618 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  43.01 
 
 
220 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 
718 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.88 
 
 
350 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  47.46 
 
 
197 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  42.56 
 
 
518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 
207 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
502 aa  157  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  42.61 
 
 
553 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  40.98 
 
 
326 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  43.21 
 
 
876 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1166  metal dependent phosphohydrolase  41.43 
 
 
396 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  41.38 
 
 
550 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  42.02 
 
 
339 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  43.85 
 
 
377 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  43.85 
 
 
377 aa  154  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  43.85 
 
 
374 aa  154  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  43.85 
 
 
373 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  44.39 
 
 
374 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  43.85 
 
 
373 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 
343 aa  153  8e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43 
 
 
498 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
339 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  40.55 
 
 
632 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 
545 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  41.72 
 
 
448 aa  152  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.4 
 
 
331 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  46.34 
 
 
387 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 
331 aa  150  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  31.23 
 
 
611 aa  150  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.34 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.57 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17380  metal dependent phosphohydrolase  46.93 
 
 
196 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  41.57 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
719 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 
353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4405  metal dependent phosphohydrolase  41.98 
 
 
186 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  44.19 
 
 
1171 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
331 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  42.44 
 
 
320 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01215  Response regulator  41.53 
 
 
509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.01 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
351 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  44.05 
 
 
201 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  39.04 
 
 
351 aa  148  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>