More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2224 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
500 aa  1029    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 
593 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.61 
 
 
971 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 
483 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.22 
 
 
465 aa  296  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 
912 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  33.47 
 
 
619 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  35.5 
 
 
599 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.82 
 
 
814 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.04 
 
 
755 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.88 
 
 
623 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  33.74 
 
 
599 aa  273  7e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.64 
 
 
853 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 
617 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 
758 aa  270  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  32.95 
 
 
803 aa  269  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  36.07 
 
 
836 aa  266  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  37.67 
 
 
526 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.26 
 
 
520 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
833 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.96 
 
 
837 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
960 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.71 
 
 
1338 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
719 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.89 
 
 
474 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
681 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 
909 aa  243  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.78 
 
 
746 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 
540 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 
539 aa  226  9e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.81 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.53 
 
 
1073 aa  209  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  33.42 
 
 
563 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  33.08 
 
 
564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.43 
 
 
841 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  34.43 
 
 
836 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1694  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 
579 aa  196  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  34.16 
 
 
792 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  30.46 
 
 
545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 
505 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.03 
 
 
550 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
561 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
683 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.05 
 
 
1125 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  42.53 
 
 
448 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  46.02 
 
 
201 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  51.27 
 
 
719 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 
608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.63 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4105  metal dependent phosphohydrolase  46.88 
 
 
199 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000135531  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.47 
 
 
860 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.47 
 
 
880 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  41.95 
 
 
334 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 
387 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 
331 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  41.38 
 
 
334 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  42.24 
 
 
363 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  43.1 
 
 
718 aa  144  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 
357 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 
357 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.28 
 
 
357 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  40.72 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  45.06 
 
 
366 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
534 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  43.87 
 
 
465 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  38.69 
 
 
651 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
506 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1882  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 
428 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.898808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
334 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
652 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.39 
 
 
331 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  44.3 
 
 
320 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.77 
 
 
333 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 
331 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.6 
 
 
343 aa  137  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  40.65 
 
 
339 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  43.67 
 
 
512 aa  137  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  31.88 
 
 
350 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 
438 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.12 
 
 
394 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.38 
 
 
375 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
346 aa  136  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  34.87 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  34.87 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  34.87 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  34.87 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  34.87 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  35.38 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.38 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  38.3 
 
 
499 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0679  response regulator receiver  37.31 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  45.66 
 
 
571 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  40.24 
 
 
357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2484  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
723 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 
220 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  36.92 
 
 
876 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  39.33 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  26.92 
 
 
771 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>