More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0823 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 
755 aa  1552    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  55.31 
 
 
1338 aa  524  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.98 
 
 
971 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  53.89 
 
 
853 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  46.79 
 
 
474 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  47.92 
 
 
526 aa  446  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.54 
 
 
746 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  56.82 
 
 
960 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  52.23 
 
 
520 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  49.11 
 
 
833 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  38.99 
 
 
836 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.3 
 
 
909 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 
619 aa  346  8.999999999999999e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  47.35 
 
 
434 aa  338  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 
483 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  41.73 
 
 
465 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 
617 aa  323  7e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
593 aa  318  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 
623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  32.42 
 
 
599 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  35.92 
 
 
803 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1164  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  32.56 
 
 
599 aa  289  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0260621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.73 
 
 
912 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 
719 aa  282  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2224  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.04 
 
 
500 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000178543  decreased coverage  1.10821e-21 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.62 
 
 
681 aa  281  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.36 
 
 
814 aa  278  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0162  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
837 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.61 
 
 
539 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2407  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.99 
 
 
758 aa  257  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  38.87 
 
 
540 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1694  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.27 
 
 
579 aa  228  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  36.07 
 
 
563 aa  227  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  36.74 
 
 
792 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.26 
 
 
1073 aa  225  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  32.78 
 
 
505 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.87 
 
 
841 aa  224  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  37.29 
 
 
836 aa  223  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  35.66 
 
 
545 aa  221  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  34.75 
 
 
564 aa  218  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2934  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.01 
 
 
683 aa  212  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.45 
 
 
550 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.38 
 
 
880 aa  194  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 
561 aa  193  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.38 
 
 
860 aa  193  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2652  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
608 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 
684 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  37.13 
 
 
420 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.4 
 
 
1125 aa  175  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.67 
 
 
431 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  35.87 
 
 
419 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.07 
 
 
431 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.41 
 
 
351 aa  170  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 
495 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  32.13 
 
 
534 aa  170  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
481 aa  169  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0759  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.08 
 
 
718 aa  169  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  48.6 
 
 
366 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  42.5 
 
 
308 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  44.71 
 
 
547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  44.71 
 
 
547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 
1237 aa  165  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  47.59 
 
 
465 aa  165  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 
357 aa  164  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1933  sensory box protein  28.85 
 
 
692 aa  163  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0364295  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  48.02 
 
 
719 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 
487 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  47.17 
 
 
201 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 
619 aa  162  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 
331 aa  162  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  41.45 
 
 
212 aa  162  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
363 aa  161  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 
331 aa  160  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  43 
 
 
334 aa  160  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
357 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
357 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  43.43 
 
 
632 aa  158  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 
207 aa  158  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.4 
 
 
503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
177 aa  157  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  41.83 
 
 
334 aa  157  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 
718 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  41.76 
 
 
876 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 
357 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  44 
 
 
379 aa  155  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  38.86 
 
 
615 aa  156  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.07 
 
 
357 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
394 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.47 
 
 
502 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  40.86 
 
 
467 aa  154  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  38.61 
 
 
444 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1892  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.68 
 
 
771 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 
334 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  39.73 
 
 
509 aa  154  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 
448 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 
220 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  39.72 
 
 
740 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  41.38 
 
 
339 aa  153  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
652 aa  153  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.41 
 
 
375 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>