More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0279 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
363 aa  742    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  42.09 
 
 
366 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 
374 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 
371 aa  232  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
719 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 
373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  33.61 
 
 
357 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.49 
 
 
860 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.49 
 
 
880 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  42.31 
 
 
1171 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 
718 aa  202  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  38.57 
 
 
387 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 
703 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 
571 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 
703 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  40.83 
 
 
692 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 
512 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.07 
 
 
491 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  43.16 
 
 
518 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 
710 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 
553 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
392 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 
574 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 
407 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  33.52 
 
 
712 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
548 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  40.25 
 
 
632 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 
649 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 
1335 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  48.62 
 
 
481 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  39.84 
 
 
650 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.4 
 
 
502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  37.6 
 
 
793 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.85 
 
 
343 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 
635 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  44.5 
 
 
499 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  44.13 
 
 
465 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  47.87 
 
 
438 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  39.15 
 
 
619 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.41 
 
 
841 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 
508 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 
571 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  43.41 
 
 
836 aa  179  9e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  43.41 
 
 
792 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  36.36 
 
 
550 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 
550 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 
495 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  46.99 
 
 
740 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.91 
 
 
513 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  41.84 
 
 
876 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  47.46 
 
 
1073 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.17 
 
 
375 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.17 
 
 
375 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  47.54 
 
 
339 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 
394 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.51 
 
 
351 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 
428 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  34.94 
 
 
770 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  47.85 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 
713 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  31.52 
 
 
565 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  39.56 
 
 
444 aa  173  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  31.15 
 
 
562 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.36 
 
 
526 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  45.7 
 
 
349 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 
347 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  41.95 
 
 
212 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  36.69 
 
 
561 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 
347 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  45.29 
 
 
308 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.55 
 
 
357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  48.55 
 
 
357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.55 
 
 
357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 
348 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 
636 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 
346 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.43 
 
 
357 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  41.58 
 
 
505 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
647 aa  169  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
710 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 
654 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
647 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 
698 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  38.43 
 
 
1237 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.3 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  36.48 
 
 
1333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 
648 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  44.92 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  40.83 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  45.51 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
718 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 
547 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  38.42 
 
 
564 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  41.84 
 
 
836 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  44.02 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>