More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0771 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 		 880 aa  1748    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  99.76 
 
 		 860 aa  1667    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  64.44 
 
 		 719 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  66.67 
 
 		 718 aa  685    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  55.7 
 
 		 392 aa  412  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  58.22 
 
 		 571 aa  399  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  52.16 
 
 		 853 aa  321  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  42.82 
 
 		 512 aa  277  8e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  39.53 
 
 		 803 aa  252  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  35.65 
 
 		 550 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 553 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 		 548 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  38.48 
 
 		 1171 aa  232  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 		 373 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 		 357 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 703 aa  221  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  34.44 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  42.75 
 
 		 632 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 		 363 aa  219  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  36.39 
 
 		 703 aa  217  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  32.68 
 
 		 371 aa  217  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  36.78 
 
 		 1333 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 		 574 aa  208  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 		 1313 aa  208  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 710 aa  207  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  34.15 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  35.15 
 
 		 387 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  44.4 
 
 		 712 aa  204  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 513 aa  204  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  51.6 
 
 		 438 aa  204  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.77 
 
 		 508 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  48.78 
 
 		 428 aa  201  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 		 502 aa  201  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 		 366 aa  201  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 		 465 aa  201  7e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 		 547 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  47.06 
 
 		 547 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  49.2 
 
 		 430 aa  197  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  26.58 
 
 		 1335 aa  197  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.07 
 
 		 971 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  33.42 
 
 		 1237 aa  196  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  51.55 
 
 		 876 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  54.49 
 
 		 481 aa  195  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  35.38 
 
 		 713 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.29 
 
 		 755 aa  194  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.79 
 
 		 343 aa  194  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  38.67 
 
 		 836 aa  194  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 		 618 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  39.93 
 
 		 419 aa  191  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  51.37 
 
 		 334 aa  191  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 651 aa  191  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 		 334 aa  190  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.75 
 
 		 491 aa  190  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.17 
 
 		 1338 aa  190  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.91 
 
 		 496 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.22 
 
 		 526 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  39.84 
 
 		 561 aa  189  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  50.27 
 
 		 718 aa  188  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  33.42 
 
 		 649 aa  187  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  48.91 
 
 		 487 aa  187  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  46.73 
 
 		 339 aa  187  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.26 
 
 		 431 aa  187  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.34 
 
 		 503 aa  187  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  51.93 
 
 		 444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.38 
 
 		 431 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  50.27 
 
 		 334 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  49.07 
 
 		 428 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  47.22 
 
 		 428 aa  185  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  51.1 
 
 		 836 aa  185  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  52.43 
 
 		 518 aa  185  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  31.67 
 
 		 770 aa  185  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  35.22 
 
 		 619 aa  185  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  38.16 
 
 		 420 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  51.1 
 
 		 792 aa  184  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.55 
 
 		 841 aa  184  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  34.5 
 
 		 698 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 565 aa  184  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 648 aa  184  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 487 aa  184  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  37.81 
 
 		 452 aa  183  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 		 407 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.77 
 
 		 506 aa  183  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.03 
 
 		 1278 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  48 
 
 		 357 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 		 495 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  33.42 
 
 		 650 aa  181  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  43.24 
 
 		 339 aa  181  7e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.5 
 
 		 357 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.5 
 
 		 357 aa  180  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.54 
 
 		 331 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 498 aa  180  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.96 
 
 		 438 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49 
 
 		 331 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  51.4 
 
 		 499 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.5 
 
 		 357 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  32.96 
 
 		 374 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  49.46 
 
 		 326 aa  177  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  47.13 
 
 		 474 aa  177  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.12 
 
 		 347 aa  177  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 		 351 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>