More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2727 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 387 aa  790    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  63.13 
 
 		 407 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  45.75 
 
 		 712 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  43.03 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 		 371 aa  210  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  42.74 
 
 		 703 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  42.74 
 
 		 703 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  36.31 
 
 		 719 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.48 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 		 692 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  42.91 
 
 		 710 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 		 465 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  38.57 
 
 		 363 aa  202  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  44.18 
 
 		 632 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 718 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 		 548 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.15 
 
 		 860 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.15 
 
 		 880 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  39.84 
 
 		 550 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  50.82 
 
 		 836 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.08 
 
 		 508 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 		 1171 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  50.27 
 
 		 792 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.7 
 
 		 513 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.27 
 
 		 841 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.71 
 
 		 526 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  51.7 
 
 		 177 aa  184  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  49.72 
 
 		 481 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 		 650 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 		 487 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 		 547 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 		 547 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.07 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  51.35 
 
 		 518 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.07 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 		 718 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.23 
 
 		 648 aa  180  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 357 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  50.28 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 		 649 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 		 496 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  44.08 
 
 		 424 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  47.57 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  29.97 
 
 		 1335 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 		 502 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  46.7 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  48.07 
 
 		 509 aa  176  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 571 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 		 710 aa  176  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.7 
 
 		 506 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  41.4 
 
 		 339 aa  175  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 		 618 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  46.74 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  46.7 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  49.14 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  42.64 
 
 		 615 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  31.23 
 
 		 619 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  41.62 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.54 
 
 		 498 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  39.92 
 
 		 713 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.51 
 
 		 328 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 698 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  44.81 
 
 		 876 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.65 
 
 		 487 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  43.84 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.93 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  38.25 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  38.4 
 
 		 793 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 1237 aa  170  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  32.38 
 
 		 848 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  38.73 
 
 		 571 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  43.68 
 
 		 451 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  46.86 
 
 		 505 aa  169  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.82 
 
 		 345 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  30.62 
 
 		 770 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  38.84 
 
 		 247 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  43.28 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  43.41 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  45.83 
 
 		 499 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  32.25 
 
 		 574 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  42.34 
 
 		 438 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  41.83 
 
 		 740 aa  166  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  40.3 
 
 		 444 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0979  metal dependent phosphohydrolase  31.1 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.98 
 
 		 719 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.13 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  49.09 
 
 		 545 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  38.98 
 
 		 771 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  48.37 
 
 		 314 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>