More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1007 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1113    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  73 
 
 		 553 aa  788    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  61.77 
 
 		 548 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 713 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.65 
 
 		 880 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.17 
 
 		 860 aa  227  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  36.1 
 
 		 710 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 719 aa  226  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  45.96 
 
 		 698 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 		 571 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.92 
 
 		 491 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  42.56 
 
 		 371 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  36.71 
 
 		 373 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.56 
 
 		 718 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.38 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  36.49 
 
 		 392 aa  208  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.81 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 		 357 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  38.95 
 
 		 632 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  51.09 
 
 		 334 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  50.8 
 
 		 334 aa  197  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 		 571 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 		 465 aa  197  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.17 
 
 		 334 aa  196  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 1171 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 		 703 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  33.72 
 
 		 703 aa  193  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  40.58 
 
 		 619 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  39.84 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 		 650 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.45 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  40.57 
 
 		 1237 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  35.61 
 
 		 692 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.66 
 
 		 343 aa  188  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  39.6 
 
 		 649 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  47.12 
 
 		 611 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  49.16 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  36.4 
 
 		 561 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  45.73 
 
 		 428 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  49.15 
 
 		 792 aa  182  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.28 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 		 547 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 770 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  39.58 
 
 		 793 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  44.12 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  39.83 
 
 		 712 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.59 
 
 		 841 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.71 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 		 565 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 562 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  29.5 
 
 		 1335 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  48.59 
 
 		 836 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 407 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  35.69 
 
 		 452 aa  177  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  31.83 
 
 		 760 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  46.15 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 		 648 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.07 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.74 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  46.23 
 
 		 339 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 		 451 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  39.74 
 
 		 563 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  44.22 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 		 615 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 		 710 aa  170  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  43.63 
 
 		 298 aa  171  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  34.7 
 
 		 618 aa  170  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  44.28 
 
 		 212 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 		 512 aa  170  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  45.81 
 
 		 509 aa  170  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  39.3 
 
 		 564 aa  170  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  38.78 
 
 		 740 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  45.18 
 
 		 317 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  45.18 
 
 		 317 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  43.39 
 
 		 876 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  43.56 
 
 		 905 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  43.5 
 
 		 545 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 487 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 		 495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  47.13 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  33.45 
 
 		 647 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  38.87 
 
 		 635 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 		 331 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 		 248 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  38.37 
 
 		 636 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 		 550 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  43.81 
 
 		 463 aa  166  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0910  metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 		 561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.69967  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  45.23 
 
 		 462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 		 647 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.15 
 
 		 357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>