More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3173 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 713 aa  1465    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  62.27 
 
 		 710 aa  884    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  85.96 
 
 		 698 aa  1201    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  45.27 
 
 		 553 aa  239  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  35.75 
 
 		 550 aa  234  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  46.19 
 
 		 548 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  55.74 
 
 		 539 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 371 aa  204  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 		 650 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.59 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 		 719 aa  191  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 		 632 aa  191  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.14 
 
 		 496 aa  190  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.26 
 
 		 491 aa  190  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.87 
 
 		 1171 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  46.6 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  32.72 
 
 		 649 aa  186  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.28 
 
 		 343 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.67 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 		 718 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  43.87 
 
 		 571 aa  185  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.38 
 
 		 880 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.38 
 
 		 860 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  42.26 
 
 		 561 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  42.11 
 
 		 876 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  45.27 
 
 		 438 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  49.15 
 
 		 499 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2145  metal dependent phosphohydrolase  46.04 
 
 		 565 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 		 547 aa  177  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  38.04 
 
 		 793 aa  177  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.67 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  46.97 
 
 		 317 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  46.97 
 
 		 317 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 373 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  42.11 
 
 		 363 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  45.05 
 
 		 308 aa  174  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 		 392 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  43.12 
 
 		 740 aa  173  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 		 247 aa  173  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  44.1 
 
 		 430 aa  173  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  43.39 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 		 703 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 1237 aa  173  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  44.32 
 
 		 487 aa  173  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  50.29 
 
 		 518 aa  173  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  39.92 
 
 		 387 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  37.66 
 
 		 357 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 		 1335 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  40.87 
 
 		 703 aa  172  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 		 1073 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1118  metal dependent phosphohydrolase  45.96 
 
 		 317 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  45.7 
 
 		 389 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 357 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  45.88 
 
 		 314 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 357 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.9 
 
 		 498 aa  169  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.58 
 
 		 364 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  30.34 
 
 		 452 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 		 480 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 		 571 aa  168  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  47.67 
 
 		 424 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  39.37 
 
 		 574 aa  167  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  38.25 
 
 		 619 aa  167  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.72 
 
 		 526 aa  167  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.64 
 
 		 357 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.74 
 
 		 357 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 		 212 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40.78 
 
 		 712 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  43.09 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  33.96 
 
 		 718 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  37.74 
 
 		 692 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  39 
 
 		 366 aa  165  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  48.37 
 
 		 450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  44.83 
 
 		 298 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  44.5 
 
 		 792 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.26 
 
 		 841 aa  164  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  41.12 
 
 		 547 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 		 710 aa  163  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 		 770 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  43.55 
 
 		 334 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  42.78 
 
 		 334 aa  161  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  43.98 
 
 		 836 aa  160  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.02 
 
 		 331 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.32 
 
 		 348 aa  160  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2803  metal dependent phosphohydrolase  42.6 
 
 		 448 aa  160  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361766  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.25 
 
 		 334 aa  160  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  40.49 
 
 		 611 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  42.25 
 
 		 220 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0220  metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 		 371 aa  159  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  41.41 
 
 		 339 aa  159  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0261  metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 		 245 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  42.71 
 
 		 474 aa  158  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>