More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1378 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  61.65 
 
 		 498 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 506 aa  1024    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.53 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 487 aa  210  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  45.75 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.52 
 
 		 513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 491 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  47.21 
 
 		 298 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  47.92 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  47.85 
 
 		 718 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  34.62 
 
 		 553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 		 719 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 		 508 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  46.11 
 
 		 618 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  46.5 
 
 		 545 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  49.23 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 		 718 aa  180  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  45.5 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 		 611 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  39.71 
 
 		 550 aa  179  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  35.02 
 
 		 692 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  42.56 
 
 		 428 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.31 
 
 		 841 aa  178  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.59 
 
 		 331 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  44.44 
 
 		 430 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  40.17 
 
 		 710 aa  176  9e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  44.85 
 
 		 792 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  41.7 
 
 		 387 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  48.59 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  47.98 
 
 		 518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.56 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  42.13 
 
 		 712 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  48.89 
 
 		 648 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  44.56 
 
 		 495 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  44.81 
 
 		 571 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 		 512 aa  172  9e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.77 
 
 		 880 aa  172  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  44.79 
 
 		 836 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  43.15 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.77 
 
 		 860 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.47 
 
 		 343 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.65 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  44.62 
 
 		 339 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.16 
 
 		 357 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  43.43 
 
 		 561 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  46.41 
 
 		 334 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  39.61 
 
 		 876 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 703 aa  170  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  46.32 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  46.32 
 
 		 373 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  46.32 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  46.32 
 
 		 374 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  45.74 
 
 		 407 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 703 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  46.32 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  46.49 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  45.86 
 
 		 334 aa  169  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  50.3 
 
 		 339 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  43.81 
 
 		 314 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  46.03 
 
 		 571 aa  168  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  37.8 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 		 548 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  49.71 
 
 		 220 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.41 
 
 		 334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 		 451 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  45.79 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.55 
 
 		 526 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  44.44 
 
 		 563 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  44.44 
 
 		 564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  45.65 
 
 		 698 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0996  sensory box protein  50.62 
 
 		 599 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  45.76 
 
 		 226 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  42.51 
 
 		 545 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  46.24 
 
 		 710 aa  163  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  50.29 
 
 		 1073 aa  163  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  45.5 
 
 		 197 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 		 713 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  43.65 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 		 328 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0402  metal dependent phosphohydrolase  41.03 
 
 		 450 aa  160  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 		 363 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 317 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 		 905 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.71 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2111  metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 		 201 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 		 770 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  42.41 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1118  metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328624  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4403  metal dependent phosphohydrolase  42.78 
 
 		 319 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>