More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2622 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  100 
 
 		 712 aa  1466    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  70.41 
 
 		 710 aa  989    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  58.66 
 
 		 703 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  61.42 
 
 		 692 aa  835    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  57.93 
 
 		 703 aa  749    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 371 aa  252  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  36.18 
 
 		 366 aa  225  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.66 
 
 		 632 aa  224  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  35.06 
 
 		 357 aa  218  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  45.75 
 
 		 387 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 719 aa  212  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 373 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 		 465 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  34.08 
 
 		 407 aa  204  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  42.91 
 
 		 718 aa  203  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  36.04 
 
 		 571 aa  203  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  37.15 
 
 		 452 aa  194  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  40.96 
 
 		 718 aa  193  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  49.47 
 
 		 451 aa  192  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 		 553 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  48.42 
 
 		 428 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 363 aa  190  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4444  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.31 
 
 		 526 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.4 
 
 		 880 aa  188  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.06 
 
 		 491 aa  188  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  31.9 
 
 		 574 aa  188  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.4 
 
 		 860 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  40.71 
 
 		 481 aa  185  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  32.33 
 
 		 648 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 		 547 aa  184  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 		 547 aa  184  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  41.74 
 
 		 561 aa  183  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  31.2 
 
 		 619 aa  183  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  49.22 
 
 		 518 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  45.92 
 
 		 487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 392 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  39.83 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 487 aa  180  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  46.96 
 
 		 430 aa  178  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 		 506 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 		 539 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  31.37 
 
 		 636 aa  174  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 		 505 aa  173  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  41.2 
 
 		 495 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 770 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 		 508 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  46.78 
 
 		 545 aa  171  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  37.59 
 
 		 571 aa  171  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51.14 
 
 		 343 aa  171  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 		 1171 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.98 
 
 		 357 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.46 
 
 		 357 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.46 
 
 		 357 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  49.44 
 
 		 905 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4475  metal dependent phosphohydrolase  47.83 
 
 		 249 aa  165  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 		 713 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 		 357 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.36 
 
 		 498 aa  163  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  38.96 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 		 177 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.25 
 
 		 1073 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0458  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 		 512 aa  162  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.079509  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  43.16 
 
 		 451 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 		 650 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  30.65 
 
 		 1335 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 		 618 aa  161  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 		 424 aa  160  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 		 615 aa  160  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  43.24 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.27 
 
 		 331 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 		 339 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 		 499 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.11 
 
 		 348 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 		 331 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2264  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  44.89 
 
 		 719 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000689674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 339 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  32.66 
 
 		 647 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  47.25 
 
 		 220 aa  158  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  42.55 
 
 		 509 aa  157  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  43.96 
 
 		 334 aa  157  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 		 348 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  45.03 
 
 		 469 aa  157  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.96 
 
 		 334 aa  157  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  42.78 
 
 		 334 aa  156  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  30.93 
 
 		 848 aa  156  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 698 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  28.75 
 
 		 760 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 		 550 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  45.76 
 
 		 463 aa  156  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 647 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  39.69 
 
 		 710 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  43.89 
 
 		 350 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 		 649 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  42.33 
 
 		 611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  44.21 
 
 		 564 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>