More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0998 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
467 aa  927    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  37.26 
 
 
428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 
428 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  49.14 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  48.55 
 
 
424 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  48.9 
 
 
876 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 
465 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 
1313 aa  176  9e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  50.86 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  43.08 
 
 
740 aa  173  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 
718 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  42.93 
 
 
509 aa  172  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.28 
 
 
1171 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
339 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 
650 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 
547 aa  170  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  45.36 
 
 
547 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  43.78 
 
 
618 aa  170  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.32 
 
 
841 aa  169  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  39.13 
 
 
1333 aa  169  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  43.85 
 
 
836 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 
351 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
430 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.15 
 
 
350 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  36.5 
 
 
649 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  43.48 
 
 
792 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  41.84 
 
 
615 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  37.34 
 
 
451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  43.63 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  43.63 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1158  metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  43.63 
 
 
373 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  43.63 
 
 
374 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.35 
 
 
1073 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  44.13 
 
 
770 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.12 
 
 
496 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  43.63 
 
 
374 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  47.25 
 
 
868 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  44.75 
 
 
648 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 
450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  43.63 
 
 
373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  40.53 
 
 
247 aa  163  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
553 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 
177 aa  162  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 
326 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 
379 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
833 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.24 
 
 
960 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  45.41 
 
 
344 aa  161  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 
487 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
363 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
366 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 
414 aa  160  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  40.58 
 
 
471 aa  160  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
495 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  45.86 
 
 
389 aa  159  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  44.92 
 
 
334 aa  159  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  36.5 
 
 
339 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.71 
 
 
491 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  42.13 
 
 
518 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.26 
 
 
513 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
428 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
451 aa  159  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  41.71 
 
 
505 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 
470 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
444 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  39.49 
 
 
451 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.02 
 
 
343 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  42.7 
 
 
331 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
710 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2627  metal dependent phosphohydrolase  43.68 
 
 
651 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.907693  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  43.85 
 
 
334 aa  158  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  40.78 
 
 
1237 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 
703 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.53 
 
 
971 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.58 
 
 
860 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.58 
 
 
880 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
354 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  43.32 
 
 
611 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  45.56 
 
 
703 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 
438 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  44.32 
 
 
350 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  44.2 
 
 
692 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.48 
 
 
483 aa  156  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0335  metal dependent phosphohydrolase  44.12 
 
 
403 aa  156  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.71 
 
 
506 aa  156  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  38.86 
 
 
619 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  42.33 
 
 
362 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  40.12 
 
 
308 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
502 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.37 
 
 
345 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.71 
 
 
487 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 
545 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.39 
 
 
334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.17 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0081  two component transcriptional regulator, AraC family  43.02 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
212 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.72 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>