More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1627 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
470 aa  936    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  45.88 
 
 
718 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  44.27 
 
 
1171 aa  170  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.89 
 
 
513 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  41.97 
 
 
619 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  41.15 
 
 
212 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
1335 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1236  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
574 aa  163  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0497288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0978  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
558 aa  163  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000628602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  40.25 
 
 
465 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 
428 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 
508 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  39.2 
 
 
247 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
539 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  36.82 
 
 
487 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1152  metal dependent phosphohydrolase  38.84 
 
 
565 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000790776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  44.26 
 
 
424 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  41.55 
 
 
387 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0998  metal dependent phosphohydrolase  37.25 
 
 
467 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000200271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1002  metal dependent phosphohydrolase  36.94 
 
 
560 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1679  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.49 
 
 
432 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.33 
 
 
351 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 
740 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 
545 aa  157  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  39.01 
 
 
362 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  36.59 
 
 
770 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  43.56 
 
 
453 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 
428 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4027  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.11 
 
 
547 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  36.87 
 
 
308 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
643 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
518 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
643 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  38.5 
 
 
339 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
643 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1099  metal dependent phosphohydrolase  40.52 
 
 
572 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00025429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.46 
 
 
368 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  36.11 
 
 
643 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1777  metal dependent phosphohydrolase, HD region with response regulator receiver modulation  40.54 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
615 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  42.49 
 
 
407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1598  metal dependent phosphohydrolase  29.64 
 
 
547 aa  153  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 
793 aa  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0885  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.31 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  41.09 
 
 
792 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1018  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
652 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1178  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
317 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1246  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
317 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 
346 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3375  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.3 
 
 
324 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 
450 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.55 
 
 
841 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1705  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.21 
 
 
471 aa  152  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0653  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 
345 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6785900000000002e-24 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  38.07 
 
 
495 aa  152  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.37 
 
 
487 aa  151  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0639  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 
345 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  42.41 
 
 
836 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  40.4 
 
 
1333 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  40.62 
 
 
649 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  34.42 
 
 
643 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0306  metal dependent phosphohydrolase  33.79 
 
 
361 aa  150  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  40.1 
 
 
571 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  45.05 
 
 
442 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
642 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  40.66 
 
 
252 aa  149  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  37.11 
 
 
650 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.81 
 
 
345 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  35.19 
 
 
642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  38.25 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.8 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  37.85 
 
 
713 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
618 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  37.4 
 
 
379 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
331 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 
331 aa  148  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  41.34 
 
 
373 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
306 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  37.98 
 
 
499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  39.8 
 
 
606 aa  147  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  41.67 
 
 
1313 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  39.82 
 
 
351 aa  147  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3082  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.62 
 
 
550 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000925788 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  39.29 
 
 
771 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  40.1 
 
 
340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  40.4 
 
 
339 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
710 aa  146  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 
331 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  46.07 
 
 
328 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1237  metal dependent phosphohydrolase  37.88 
 
 
286 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 
269 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 
698 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  33.74 
 
 
349 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.99 
 
 
343 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>