More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1513 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1513  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
294 aa  587  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1151  metal dependent phosphohydrolase  64.21 
 
 
248 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0208  metal dependent phosphohydrolase  62.11 
 
 
229 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0796  metal dependent phosphohydrolase  55.85 
 
 
263 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0261  metal dependent phosphohydrolase  56.28 
 
 
245 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  46.67 
 
 
220 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  53.53 
 
 
343 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  50 
 
 
334 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  49.15 
 
 
334 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
334 aa  175  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2131  metal dependent phosphohydrolase  48.57 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000504483  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  46.53 
 
 
876 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  45.86 
 
 
207 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  46.59 
 
 
197 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  45.36 
 
 
632 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  49.45 
 
 
553 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
718 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.5 
 
 
357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.5 
 
 
357 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  49.46 
 
 
719 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46 
 
 
357 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  48.35 
 
 
550 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 
326 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.6 
 
 
347 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  50.28 
 
 
502 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1949  metal dependent phosphohydrolase  45.08 
 
 
226 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000478205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  49.43 
 
 
210 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  49.16 
 
 
438 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  51.15 
 
 
481 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.09 
 
 
347 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 
462 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.5 
 
 
880 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.5 
 
 
860 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  45.93 
 
 
770 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0907  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 
548 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.94 
 
 
348 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.21 
 
 
506 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000458361  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1136  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.24 
 
 
391 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 
465 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  47.43 
 
 
836 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  46.78 
 
 
339 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.97 
 
 
487 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1793  metal dependent phosphohydrolase  41.18 
 
 
298 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000123225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 
387 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  45.35 
 
 
505 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  45.25 
 
 
710 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  46.86 
 
 
792 aa  159  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  44.69 
 
 
718 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.86 
 
 
841 aa  159  6e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3089  metal dependent phosphohydrolase  41.62 
 
 
366 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  45.2 
 
 
698 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  45.71 
 
 
350 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  43.88 
 
 
561 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  46.24 
 
 
444 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 
1073 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1339  metal dependent phosphohydrolase  47.4 
 
 
463 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000978961  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  41.34 
 
 
563 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 
339 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.14 
 
 
348 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  45.36 
 
 
349 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.18 
 
 
513 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.3 
 
 
755 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  43.82 
 
 
1335 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.05 
 
 
498 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.39 
 
 
491 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.86 
 
 
357 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  44.97 
 
 
615 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
547 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
547 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3638  metal dependent phosphohydrolase  47.16 
 
 
252 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 
833 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1184  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.55 
 
 
394 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  41.99 
 
 
363 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  46.82 
 
 
509 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  40.78 
 
 
564 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0881  group-specific protein  42.7 
 
 
373 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.57625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  40.76 
 
 
648 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 
483 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 
375 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  43.53 
 
 
618 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 
407 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0914  HD domain-containing protein  42.7 
 
 
377 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0897  HD domain-containing protein  42.7 
 
 
373 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000539881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1052  HD domain protein  42.7 
 
 
374 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34036e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0975  HD domain-containing protein  42.7 
 
 
377 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1360  metal dependent phosphohydrolase  43.79 
 
 
428 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.624782  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.26 
 
 
960 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  43.72 
 
 
611 aa  152  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1265  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 
375 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297476  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.86 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  43.43 
 
 
617 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1326  metal dependent phosphohydrolase  43.2 
 
 
428 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00151166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.28 
 
 
508 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3549  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.93 
 
 
348 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  49.43 
 
 
571 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  45.98 
 
 
379 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.46 
 
 
378 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1141  HD domain protein  42.7 
 
 
374 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.13 
 
 
853 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0691  metal dependent phosphohydrolase  48.28 
 
 
392 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>