More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1175 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 389 aa  800    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  40.81 
 
 		 1301 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  36.72 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  40.33 
 
 		 771 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.08 
 
 		 480 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  47.75 
 
 		 471 aa  219  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  53.48 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  51.02 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  52.66 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  47.83 
 
 		 458 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  48 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  44.9 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  48.94 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  51.89 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  49.19 
 
 		 357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  47.64 
 
 		 642 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  47.64 
 
 		 642 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  44.39 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  48.42 
 
 		 848 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 		 643 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  47.17 
 
 		 642 aa  196  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 		 643 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  47.03 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 		 643 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 		 643 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  46.7 
 
 		 643 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  45.32 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  45.95 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 		 452 aa  192  7e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.24 
 
 		 492 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  51.69 
 
 		 469 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  46.52 
 
 		 631 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.7 
 
 		 363 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.6 
 
 		 364 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.93 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  42.49 
 
 		 600 aa  159  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1511  hypothetical protein  35.86 
 
 		 258 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.256136  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1941  metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000817968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 		 718 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  38.38 
 
 		 618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  36.52 
 
 		 545 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2045  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 373 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.803605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 703 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  43.82 
 
 		 495 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 		 703 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.29 
 
 		 860 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 		 430 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.29 
 
 		 880 aa  147  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  33.47 
 
 		 1171 aa  146  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.12 
 
 		 833 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 		 553 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  36.76 
 
 		 615 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3115  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.97 
 
 		 626 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.972183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  39.42 
 
 		 339 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3117  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 868 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.411683  normal  0.363109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  33.2 
 
 		 550 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 692 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  40.59 
 
 		 648 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  33.72 
 
 		 712 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  35.09 
 
 		 719 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  28.91 
 
 		 635 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 		 547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  34.32 
 
 		 561 aa  141  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  38.5 
 
 		 547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  28.94 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  39.77 
 
 		 632 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  41.08 
 
 		 320 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  39.58 
 
 		 451 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 487 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 770 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3699  metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 		 469 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1437  metal dependent phosphohydrolase  34.89 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  38.25 
 
 		 481 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 513 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 		 649 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0764  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  39.66 
 
 		 509 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3705  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 861 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0546  metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 		 451 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.880848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  38.19 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  39.51 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  39.43 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  37.22 
 
 		 462 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  36.76 
 
 		 308 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  35.78 
 
 		 713 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0679  metal dependent phosphohydrolase  33.99 
 
 		 571 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 414 aa  136  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  30.29 
 
 		 574 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.34 
 
 		 841 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 710 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>