More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1612 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
305 aa  638    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  53.19 
 
 
389 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.85 
 
 
480 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  53.19 
 
 
1301 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  50.97 
 
 
471 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  51.37 
 
 
771 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  52.94 
 
 
334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  52.13 
 
 
384 aa  212  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  50.54 
 
 
458 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  53.8 
 
 
848 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  49.46 
 
 
474 aa  206  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  51.89 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
453 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  47.85 
 
 
469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 
357 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  46.77 
 
 
341 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1817  metal dependent phosphohydrolase  47.89 
 
 
446 aa  192  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.44 
 
 
492 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  46.2 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  42.36 
 
 
631 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  47.34 
 
 
643 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  47.34 
 
 
643 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  47.34 
 
 
643 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  47.34 
 
 
643 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  45.21 
 
 
642 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  45.65 
 
 
643 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  38.43 
 
 
359 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 
452 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
642 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  43.62 
 
 
642 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  42.35 
 
 
495 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  40.29 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  43.6 
 
 
465 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  41.33 
 
 
571 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.5 
 
 
361 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  44.57 
 
 
545 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.23 
 
 
364 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  40.11 
 
 
692 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  41.3 
 
 
632 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.27 
 
 
363 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  39.89 
 
 
648 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
547 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.67 
 
 
547 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  38.33 
 
 
487 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  37.14 
 
 
326 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
703 aa  142  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  37.1 
 
 
574 aa  142  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  34.6 
 
 
339 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  39.38 
 
 
387 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
703 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  40.91 
 
 
710 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1194  metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.01 
 
 
491 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  43.6 
 
 
600 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
371 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 
462 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  36.27 
 
 
876 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2498  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
367 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.751736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0899  hypothetical protein  38.86 
 
 
294 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000973065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  40.22 
 
 
353 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  40.56 
 
 
220 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  38.04 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40.91 
 
 
712 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  38.17 
 
 
509 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.44 
 
 
268 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 
611 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
407 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  41.61 
 
 
334 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  38.28 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  40.24 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 
513 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1432  metal dependent phosphohydrolase  38.82 
 
 
207 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000116071  normal  0.0291247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  38.3 
 
 
718 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  40.12 
 
 
518 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.64 
 
 
368 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4565  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.08 
 
 
833 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0183003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0273  metal dependent phosphohydrolase  40.83 
 
 
534 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.576727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1512  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  57.14 
 
 
110 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.752891  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
770 aa  132  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0279  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 
363 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258813  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 
363 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  37.11 
 
 
499 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 
177 aa  132  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1559  metal-dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 
698 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000474129  normal  0.225702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0473  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
424 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00121075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 
635 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  36.56 
 
 
550 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  38.01 
 
 
430 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.57 
 
 
368 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1141  metal dependent phosphohydrolase  40.94 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000147329  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0497  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.45 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3527  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 
562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  33.67 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.12 
 
 
334 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.46 
 
 
365 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.73 
 
 
1125 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.59 
 
 
379 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  37.75 
 
 
344 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  37.95 
 
 
719 aa  129  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>