More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0567 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0567  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 693 aa  1420    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0002  putative PAS/PAC sensor protein  43.6 
 
 		 690 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1421  putative PAS/PAC sensor protein  39.35 
 
 		 687 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.377844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1157  putative PAS/PAC sensor protein  39.28 
 
 		 723 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1974  putative PAS/PAC sensor protein  39.64 
 
 		 701 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0637  putative PAS/PAC sensor protein  30.22 
 
 		 716 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1154  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 		 706 aa  240  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.986646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1559  metal-dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 		 698 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000474129  normal  0.225702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  32.27 
 
 		 471 aa  151  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  33.54 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  30.03 
 
 		 341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  38.95 
 
 		 359 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  36.41 
 
 		 771 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1507  putative PAS/PAC sensor protein  29.87 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000751678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  37.3 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 		 1301 aa  124  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  38.32 
 
 		 458 aa  124  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  41.99 
 
 		 848 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  37.23 
 
 		 334 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  35.38 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  33.64 
 
 		 632 aa  122  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  35.26 
 
 		 305 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 		 1171 aa  120  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.97 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 		 389 aa  120  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.3 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  34.58 
 
 		 474 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  38.98 
 
 		 387 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  37.35 
 
 		 371 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 452 aa  112  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.96 
 
 		 841 aa  112  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  39.52 
 
 		 703 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 465 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  33.89 
 
 		 710 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 430 aa  110  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.93 
 
 		 513 aa  110  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 770 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 1237 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 545 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  38.92 
 
 		 703 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  35.03 
 
 		 407 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  33.2 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  36.93 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3292  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  38.24 
 
 		 836 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 905 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 642 aa  108  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 545 aa  107  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  38.79 
 
 		 792 aa  107  6e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 643 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1627  metal dependent phosphohydrolase  32.49 
 
 		 470 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  32.34 
 
 		 308 aa  106  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  28.9 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  32.32 
 
 		 713 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3977  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 231 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.750447 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3863  metal dependent phosphohydrolase  36.41 
 
 		 231 aa  106  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1669  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 499 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  38.24 
 
 		 481 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 642 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  31.2 
 
 		 487 aa  105  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 364 aa  104  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 547 aa  104  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 547 aa  104  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.46 
 
 		 361 aa  104  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0538  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 363 aa  104  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.3 
 
 		 351 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0307  hypothetical protein  35.36 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2622  HAMP domain/GAF domain/HD domain-containing protein  40.36 
 
 		 712 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0849  metal dependent phosphohydrolase  40.36 
 
 		 710 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.86 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  34.76 
 
 		 740 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3894  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.73 
 
 		 353 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109719  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  34.83 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3561  metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.878767  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.21 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.63 
 
 		 384 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1713  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 692 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000361253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 351 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1469  metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 		 326 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.664094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  27.67 
 
 		 339 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  34.73 
 
 		 876 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 508 aa  101  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1575  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  34.27 
 
 		 561 aa  101  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.874521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0459  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 		 636 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 487 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1201  metal dependent phosphohydrolase  37.65 
 
 		 719 aa  100  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  33.33 
 
 		 353 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.23 
 
 		 379 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>