More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3001 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3001  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 420 aa  863    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0627  metal dependent phosphohydrolase  56.94 
 
 		 420 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.84038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2799  metal-dependent phosphohydrolase  55.32 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0938025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3561  metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.878767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0752  metal dependent phosphohydrolase  50.24 
 
 		 306 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0100091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2274  metal-dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.293482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1357  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 		 331 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.23 
 
 		 331 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.75 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 		 328 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.63 
 
 		 345 aa  173  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  45.11 
 
 		 338 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0187  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.3 
 
 		 354 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  39 
 
 		 793 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4196  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.92 
 
 		 350 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  40.11 
 
 		 1171 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.94 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.09 
 
 		 331 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3408  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.75 
 
 		 346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.16 
 
 		 331 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  39.07 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  43.78 
 
 		 337 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0961  metal dependent phosphohydrolase  42.39 
 
 		 212 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3410  hypothetical protein  44.83 
 
 		 1333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277305  normal  0.24869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1086  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.06 
 
 		 331 aa  163  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.226857  hitchhiker  0.0000000112469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  35.56 
 
 		 606 aa  163  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0061  metal dependent phosphohydrolase  40.64 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  40.55 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0838  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  48.26 
 
 		 378 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0150  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3313  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.62 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0206  metal-dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1911  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  42.27 
 
 		 268 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0445959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0835  metal dependent phosphohydrolase  37.63 
 
 		 247 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.9 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 		 650 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  41.97 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  40.57 
 
 		 649 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1813  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.55 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0479529  normal  0.434013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3194  putative PAS/PAC sensor protein  40.33 
 
 		 740 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27782  normal  0.189469 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  41.24 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1050  metal dependent phosphohydrolase  46.55 
 
 		 1313 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2325  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.06 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.663275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.97 
 
 		 338 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  40.66 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2545  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 		 269 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.97 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.97 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1019  putative response regulator  41.29 
 
 		 522 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3285  response regulator receiver  37.5 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1613  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.77 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350204  hitchhiker  0.000130728 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.54 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.21 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  39.49 
 
 		 619 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 		 539 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0097  putative PAS/PAC sensor protein  36.93 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.27 
 
 		 365 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1739  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.09 
 
 		 362 aa  156  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.29 
 
 		 347 aa  156  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.45 
 
 		 338 aa  156  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.63 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  39.36 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 		 1335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2247  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.77168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0079  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 328 aa  154  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.22 
 
 		 368 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2574  response regulator  41.09 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1999  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 1237 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.974875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 		 348 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.45 
 
 		 339 aa  153  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3640  metal dependent phosphohydrolase  45.24 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.35 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2085  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.77 
 
 		 345 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.012958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2370  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.28 
 
 		 370 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2670  metal dependent phosphohydrolase, HD region  41.62 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0663  response regulator receiver  41.85 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2366  response regulator  41.79 
 
 		 525 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  45.78 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0007  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.09 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  46.63 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2546  metal-dependent phosphohydrolase  41.88 
 
 		 515 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2833  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0209293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 		 718 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0148  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.19 
 
 		 385 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0591  putative membrane associated signaling protein  40 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.05 
 
 		 508 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3509  metal-dependent phosphohydrolase  43.18 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.84 
 
 		 343 aa  150  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.19 
 
 		 632 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.41 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  37.88 
 
 		 654 aa  150  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3816  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.18 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0960158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2902  response regulator receiver  41.75 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.246098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>