More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2168 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2168  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 711 aa  1456    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2049  multi-sensor signal transduction histidine kinase  94.5 
 
 		 711 aa  1330    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3148  sensor histidine kinase  43.94 
 
 		 671 aa  547  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 837 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0469  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 774 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 689 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 689 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2046  metal dependent phosphohydrolase  40.63 
 
 		 647 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.391167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2171  metal dependent phosphohydrolase  42.01 
 
 		 647 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1408  metal dependent phosphohydrolase  40.4 
 
 		 654 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2100  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 751 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 751 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3236  metal dependent phosphohydrolase  39.32 
 
 		 636 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1019  metal dependent phosphohydrolase  39.17 
 
 		 635 aa  319  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.416767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  34.71 
 
 		 760 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 591 aa  230  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0875  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 368 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  41.9 
 
 		 614 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 		 1003 aa  219  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.96 
 
 		 483 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 396 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 604 aa  218  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2762  histidine kinase  47.22 
 
 		 558 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1286  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 859 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 536 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 510 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 		 775 aa  213  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  45.16 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2444  sensor histidine kinase  45.85 
 
 		 610 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.119384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  44.4 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 628 aa  210  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  43.97 
 
 		 583 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  38.53 
 
 		 363 aa  207  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  41.76 
 
 		 616 aa  207  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 1354 aa  207  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 		 556 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 616 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2770  histidine kinase  49.08 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2297  sensory box histidine kinase  41.37 
 
 		 762 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 		 738 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0097  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 1224 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.105547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2567  two component sensor histidine kinase  38.64 
 
 		 526 aa  200  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  42.91 
 
 		 794 aa  200  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  40.22 
 
 		 533 aa  200  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3455  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  41.41 
 
 		 767 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 517 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2667  sensory box histidine kinase  41.06 
 
 		 498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 547 aa  197  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 		 587 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000947824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0475  sensory box histidine kinase  42.06 
 
 		 622 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0666  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 618 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 		 778 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  42.15 
 
 		 770 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  42.69 
 
 		 733 aa  195  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1756  PAS sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 718 aa  195  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.977279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2565  sensor histidine kinase  42.28 
 
 		 255 aa  194  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 		 604 aa  194  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0881  sensor histidine kinase  41.86 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2845  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 545 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000115656  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 807 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 519 aa  190  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 904 aa  190  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 891 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 779 aa  189  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0011  histidine kinase  43.88 
 
 		 330 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0314  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 583 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5638  histidine kinase  42.74 
 
 		 540 aa  187  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2086  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 798 aa  186  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0947899999999999e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2669  sensor histidine kinase  43.03 
 
 		 343 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0010  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 363 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 394 aa  185  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 502 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 572 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1036  sensor histidine kinase  42.04 
 
 		 579 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.696907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  38.58 
 
 		 703 aa  184  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 578 aa  184  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2070  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 645 aa  184  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000789609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2571  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 406 aa  184  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.156881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 486 aa  183  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0161289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 		 810 aa  183  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0852026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4421  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  38.1 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  40.41 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0103  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 		 639 aa  182  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1642  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.905013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  41.9 
 
 		 749 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 857 aa  181  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2790  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 463 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 1177 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  42.47 
 
 		 282 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 639 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2737  histidine kinase  40.33 
 
 		 523 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0302  histidine kinase  44.78 
 
 		 584 aa  178  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>