More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1718 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 470 aa  971    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.89 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 		 819 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 849 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 		 864 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  39.03 
 
 		 1268 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.81 
 
 		 1260 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1086 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 1260 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1092 aa  236  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  35.05 
 
 		 1086 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1076 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 1132 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 673 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 		 1322 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 953 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 853 aa  225  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1279 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 859 aa  222  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 962 aa  221  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 645 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4271  histidine kinase  35 
 
 		 525 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1050 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2669  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 1047 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 743 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 1113 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1108 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 		 1176 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 796 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000698755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 649 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 650 aa  212  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  35.49 
 
 		 1015 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2001  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 796 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  7.77001e-34 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 926 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 1053 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.49 
 
 		 1105 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1566  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 1047 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 689 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0334119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 		 423 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 711 aa  209  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3045  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 954 aa  209  9e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00011876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 642 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 689 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 741 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  41.67 
 
 		 490 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 661 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  34.04 
 
 		 1561 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 637 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 983 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 789 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 740 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3966  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 677 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000186378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.32 
 
 		 828 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00791305  hitchhiker  0.0012729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 903 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198382 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 837 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1744  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 376 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000105238  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2602  PAS sensor protein  41.92 
 
 		 903 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1524  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 		 853 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.334346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  35.75 
 
 		 812 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  33.01 
 
 		 726 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 654 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 		 906 aa  203  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 1115 aa  203  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1039  sensory box histidine kinase/response regulator  42.52 
 
 		 945 aa  203  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 639 aa  203  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 663 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2124  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 		 857 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1929  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 		 853 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 673 aa  202  9e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 753 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  33.51 
 
 		 936 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  42.96 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  45.24 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  40 
 
 		 1278 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 769 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  38.31 
 
 		 892 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1225 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 660 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 632 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 874 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0139218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 936 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 773 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1727  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 		 793 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 642 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1134 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 		 581 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1004  sensory box histidine kinase/response regulator  42.29 
 
 		 945 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 807 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1700  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 		 850 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.99866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 1215 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 557 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 789 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 789 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 641 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 655 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1140 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0035  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 		 921 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.31 
 
 		 810 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1952  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 692 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>