More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0238 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  100 
 
 		 1629 aa  3339    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 		 933 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  47.78 
 
 		 652 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.96 
 
 		 684 aa  457  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  42.69 
 
 		 509 aa  391  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 799 aa  325  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  40.28 
 
 		 614 aa  324  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.12 
 
 		 829 aa  298  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1207 aa  298  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 953 aa  296  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 1060 aa  295  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 		 503 aa  293  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 		 1043 aa  290  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1002 aa  285  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 965 aa  284  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 823 aa  282  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  58.37 
 
 		 225 aa  278  5e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 687 aa  278  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.69 
 
 		 1068 aa  278  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.08 
 
 		 226 aa  278  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.01 
 
 		 224 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 		 1271 aa  277  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 		 1084 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.01 
 
 		 224 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.01 
 
 		 224 aa  275  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  52.87 
 
 		 1026 aa  274  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.48 
 
 		 1274 aa  274  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  35.4 
 
 		 1361 aa  274  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.42 
 
 		 635 aa  272  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 799 aa  272  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 977 aa  272  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.25 
 
 		 839 aa  271  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  39.23 
 
 		 613 aa  271  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 225 aa  269  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.23 
 
 		 635 aa  269  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 225 aa  269  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1064 aa  268  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1362 aa  268  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1090 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 		 1090 aa  263  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 1022 aa  262  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  35.67 
 
 		 597 aa  262  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 557 aa  261  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 801 aa  261  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 974 aa  257  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 755 aa  256  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.41 
 
 		 224 aa  256  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 944 aa  255  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 1291 aa  253  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 1046 aa  253  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 858 aa  253  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  50.2 
 
 		 725 aa  251  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 1141 aa  249  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 776 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 698 aa  245  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 1418 aa  245  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 		 1501 aa  243  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1172 aa  242  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  31.92 
 
 		 910 aa  240  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 1049 aa  240  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 		 874 aa  239  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 975 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 1237 aa  236  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 674 aa  234  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.21 
 
 		 823 aa  233  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  31.99 
 
 		 1111 aa  232  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 1407 aa  232  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 		 1266 aa  232  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 		 776 aa  232  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 1195 aa  231  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1356 aa  231  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 791 aa  230  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 1145 aa  229  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1352 aa  229  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 1354 aa  229  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 637 aa  228  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 881 aa  228  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  29.1 
 
 		 998 aa  227  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 		 1203 aa  228  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 1021 aa  225  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  28.97 
 
 		 1137 aa  225  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1003 aa  224  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1137 aa  224  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 		 697 aa  224  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 230 aa  223  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 927 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1142 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  30.68 
 
 		 713 aa  223  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.78 
 
 		 970 aa  222  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 		 796 aa  222  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 979 aa  220  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 798 aa  220  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 1159 aa  220  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 671 aa  220  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.143322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1896 aa  219  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.39 
 
 		 1126 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.26 
 
 		 1535 aa  219  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 		 234 aa  219  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1143 aa  218  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 1954 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>