More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1445 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.89 
 
 		 226 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.23 
 
 		 224 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.61 
 
 		 224 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.16 
 
 		 224 aa  291  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 1629 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 		 799 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 		 635 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2421  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  59.01 
 
 		 684 aa  261  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243595 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3722  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 635 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.940611  normal  0.125775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 652 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1723  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 597 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000776738 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0163  multi-component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 725 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.892768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  55.31 
 
 		 613 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4228  winged helix family two component transcriptional regulator  52.91 
 
 		 509 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.290807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0298  winged helix family two component transcriptional regulator  57.21 
 
 		 230 aa  231  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.88518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4548  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  55.16 
 
 		 614 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 240 aa  192  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 283 aa  191  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 226 aa  191  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  42.86 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 257 aa  191  8e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 230 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 250 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0436  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 		 245 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  40.62 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  39.73 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  43.42 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 238 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5187  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000511147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  44.39 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 227 aa  181  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 244 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  40.89 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  41.05 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 250 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  45.58 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5305  winged helix family two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 244 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217359  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  46.26 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  41.44 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 220 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>