More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1595 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  72.05 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  72.05 
 
 		 231 aa  328  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.81 
 
 		 228 aa  325  4.0000000000000003e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  71.93 
 
 		 230 aa  322  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  71.93 
 
 		 230 aa  322  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  71.93 
 
 		 230 aa  322  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  72.37 
 
 		 230 aa  322  3e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.65 
 
 		 229 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  73.66 
 
 		 234 aa  297  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  63.75 
 
 		 246 aa  296  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  71.18 
 
 		 229 aa  289  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  72.37 
 
 		 228 aa  289  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.49 
 
 		 228 aa  288  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.6 
 
 		 229 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  63.4 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  63.88 
 
 		 237 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.86 
 
 		 223 aa  262  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.01 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.15 
 
 		 254 aa  255  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  58.56 
 
 		 224 aa  254  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  58.56 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  56.19 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.05 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  55.8 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  55.02 
 
 		 406 aa  234  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.23 
 
 		 223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  53.36 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 223 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  56.19 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  50.89 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  51.79 
 
 		 236 aa  224  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.17 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  50.67 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.1 
 
 		 273 aa  220  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  53.98 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  48.66 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.34 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 226 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  49.78 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  50 
 
 		 241 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  47.77 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  56.36 
 
 		 227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  49.35 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 239 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 244 aa  211  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.88 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  48.44 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 224 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  50.22 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.09 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.56 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  50 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>