More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3081 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  80.63 
 
 		 224 aa  374  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  80.18 
 
 		 224 aa  367  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.63 
 
 		 224 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  78.83 
 
 		 224 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  80.18 
 
 		 224 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  72.2 
 
 		 223 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.42 
 
 		 223 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  58.56 
 
 		 240 aa  276  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  64.25 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3752  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 224 aa  275  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000783534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.86 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.3 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.15 
 
 		 225 aa  247  8e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  55.41 
 
 		 223 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 230 aa  241  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0317  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  52.49 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 225 aa  237  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 283 aa  236  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 		 235 aa  235  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 		 235 aa  235  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  52.04 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 238 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 224 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  52.49 
 
 		 224 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 222 aa  234  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  51.58 
 
 		 224 aa  234  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  50.67 
 
 		 226 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  50.22 
 
 		 252 aa  233  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  50.67 
 
 		 228 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  51.58 
 
 		 224 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 223 aa  232  3e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 222 aa  231  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 		 226 aa  231  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  231  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  51.58 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  51.58 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  231  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.22 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 222 aa  230  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 223 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 249 aa  228  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 224 aa  228  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  227  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  53.15 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.49 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.49 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.7 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  50.23 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  51.13 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  50.67 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.88 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.94 
 
 		 225 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 248 aa  225  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  51.13 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.88 
 
 		 226 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  50 
 
 		 230 aa  224  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  52.21 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  52.04 
 
 		 226 aa  224  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  52.04 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>