More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0655 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  93.9 
 
 		 246 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.44 
 
 		 273 aa  342  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  67.09 
 
 		 236 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.96 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.49 
 
 		 243 aa  321  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.36 
 
 		 242 aa  318  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  62.9 
 
 		 248 aa  318  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.53 
 
 		 271 aa  316  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  61.6 
 
 		 406 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  62.1 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  66.08 
 
 		 231 aa  298  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  61.07 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.93 
 
 		 252 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 249 aa  289  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  60.4 
 
 		 250 aa  288  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  53.5 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.44 
 
 		 237 aa  257  9e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.22 
 
 		 239 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.36 
 
 		 240 aa  244  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.45 
 
 		 242 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.79 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  54.46 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.94 
 
 		 248 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.91 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.15 
 
 		 235 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.48 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  48.76 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  51.74 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.91 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  51.3 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.66 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  54.02 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  54.02 
 
 		 233 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 239 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.16 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.05 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  51.95 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  49.56 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  49.79 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  49.33 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  51.13 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.96 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  47.83 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 		 236 aa  218  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 229 aa  218  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  47.96 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 228 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  43.5 
 
 		 241 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 228 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  43.75 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  44.02 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 246 aa  188  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  40.09 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.05 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>