More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1873 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  67.7 
 
 		 228 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.73 
 
 		 224 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.18 
 
 		 224 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  66.82 
 
 		 224 aa  301  6.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.18 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 		 225 aa  228  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  225  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 236 aa  222  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  47.6 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  46.49 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 227 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 223 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  47.06 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 224 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 235 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 233 aa  208  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  46.02 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 224 aa  204  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2305  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1205  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 222 aa  202  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 227 aa  201  5e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  45.81 
 
 		 241 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 246 aa  201  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 248 aa  201  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1922  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  44.2 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  45.41 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  40.36 
 
 		 236 aa  194  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 238 aa  193  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.6 
 
 		 271 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1212  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0899901  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4346  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 384 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0299016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  42.47 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 406 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  41.89 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  47.79 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.24 
 
 		 257 aa  191  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>