More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6588 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  89.08 
 
 		 242 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  70.22 
 
 		 246 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.23 
 
 		 231 aa  292  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  59.19 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  58.74 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.73 
 
 		 240 aa  271  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  60 
 
 		 235 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.59 
 
 		 235 aa  264  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.7 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.26 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  58.41 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  57.96 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.19 
 
 		 236 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  57.08 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.89 
 
 		 244 aa  258  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 243 aa  257  8e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.03 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  56.96 
 
 		 237 aa  255  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  57.14 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.4 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  53.98 
 
 		 241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  56.19 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  56.58 
 
 		 239 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.33 
 
 		 238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 241 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  58.67 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  56.19 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.6 
 
 		 236 aa  251  7e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 406 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  58.04 
 
 		 234 aa  248  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  58.67 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  57.89 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.61 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.8 
 
 		 271 aa  245  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.39 
 
 		 258 aa  244  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.78 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  50 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  55.07 
 
 		 255 aa  241  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.5 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.9 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.93 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  52.65 
 
 		 257 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  49.59 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  54.02 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.78 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  52.23 
 
 		 230 aa  224  9e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 231 aa  223  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 242 aa  221  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  50.22 
 
 		 286 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.89 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  48.96 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  52.47 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  53.57 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  53.3 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 228 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 236 aa  207  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 244 aa  207  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.9 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  46.35 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>