More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0379 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  63.64 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  62.88 
 
 		 248 aa  276  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.13 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  60.87 
 
 		 236 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.8 
 
 		 236 aa  266  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.44 
 
 		 271 aa  262  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.27 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  59.39 
 
 		 406 aa  259  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.58 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.35 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 252 aa  255  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  56.28 
 
 		 239 aa  255  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.27 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.6 
 
 		 239 aa  251  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.74 
 
 		 243 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.21 
 
 		 242 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  57.27 
 
 		 233 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  56 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  58.52 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  58.52 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  58.52 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  57.58 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  58.48 
 
 		 242 aa  244  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  56.71 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  59.05 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.94 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.59 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.84 
 
 		 236 aa  241  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  57.83 
 
 		 249 aa  241  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  58.93 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.76 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  51.75 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  54.7 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.09 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.11 
 
 		 244 aa  234  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  51.08 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  58.3 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  53.25 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  52.61 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  52.61 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  52.61 
 
 		 239 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.51 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.09 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  51.32 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  46.86 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  54.42 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  54.22 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  54.46 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  51.29 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 229 aa  221  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  53.78 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.87 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 		 248 aa  207  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  50.22 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  48.54 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 252 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  42.6 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.49 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  42.34 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>