More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3221 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  99.11 
 
 
224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  96.88 
 
 
224 aa  441  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  96.43 
 
 
224 aa  441  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  96.88 
 
 
224 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  96.43 
 
 
224 aa  441  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.85 
 
 
225 aa  275  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  53.57 
 
 
240 aa  257  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  52.91 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 
224 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  51.58 
 
 
223 aa  234  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
224 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.57 
 
 
224 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  231  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  50.68 
 
 
219 aa  229  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 
227 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 
224 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2122  DNA-binding response regulator  47.51 
 
 
223 aa  228  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 
224 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  50 
 
 
224 aa  224  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
222 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 
228 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 
223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 
228 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 
225 aa  218  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 
223 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
283 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.18 
 
 
223 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 
228 aa  215  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 
223 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  50.23 
 
 
228 aa  215  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0202  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.64 
 
 
226 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 
223 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 
223 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
273 aa  214  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 
232 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
223 aa  214  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 
232 aa  214  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 
231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 
228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 
225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 
225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 
228 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 
224 aa  211  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  47.3 
 
 
228 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 
225 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 
224 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  47.27 
 
 
223 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  48.64 
 
 
224 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 
229 aa  209  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.32 
 
 
225 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 
227 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 
231 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1658  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 
230 aa  209  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450735  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  46.15 
 
 
253 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  48.18 
 
 
229 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.09 
 
 
225 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 
226 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 
227 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  45.95 
 
 
223 aa  208  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 
230 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 
230 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 
230 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 
230 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 
226 aa  208  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 
224 aa  208  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 
224 aa  208  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 
230 aa  208  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  47.32 
 
 
226 aa  208  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
226 aa  208  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.66 
 
 
225 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.66 
 
 
225 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.66 
 
 
225 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  48.88 
 
 
226 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 
235 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3058  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 
227 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3075  DNA-binding transcriptional activator CusR  48.88 
 
 
227 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204173  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0618  DNA-binding transcriptional activator CusR  48.88 
 
 
227 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000374882  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.73 
 
 
223 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0651  DNA-binding transcriptional activator CusR  48.88 
 
 
227 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589216  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.91 
 
 
224 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 
226 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0588  DNA-binding transcriptional activator CusR  48.88 
 
 
227 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.372008  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00521  hypothetical protein  48.43 
 
 
227 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
227 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 
224 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  43.81 
 
 
227 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
232 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0422  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.51 
 
 
227 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0589  DNA-binding transcriptional activator CusR  48.43 
 
 
227 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.66 
 
 
225 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>