More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0717 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  82.13 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.81 
 
 		 243 aa  371  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.88 
 
 		 236 aa  362  4e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.15 
 
 		 239 aa  356  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.74 
 
 		 241 aa  344  8.999999999999999e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  73.62 
 
 		 236 aa  339  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  73.42 
 
 		 239 aa  335  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.73 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  67.8 
 
 		 243 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.53 
 
 		 236 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  66.39 
 
 		 246 aa  325  3e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  70.51 
 
 		 239 aa  322  4e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.77 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  68.1 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  67.24 
 
 		 233 aa  304  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  65.96 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  65.96 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  65.96 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.8 
 
 		 244 aa  297  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  67.51 
 
 		 235 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  62.66 
 
 		 236 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  62.24 
 
 		 238 aa  289  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  63.4 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  63.09 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.92 
 
 		 271 aa  287  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  64.26 
 
 		 237 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  67.1 
 
 		 234 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  64.66 
 
 		 234 aa  284  9e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  62.29 
 
 		 233 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.42 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.07 
 
 		 236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  61.21 
 
 		 406 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  61.28 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  59.05 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.14 
 
 		 231 aa  271  5.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  60.85 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.31 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.26 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.51 
 
 		 230 aa  267  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  58.65 
 
 		 239 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  59.39 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  57.69 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  60.7 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  54.55 
 
 		 241 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.7 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  58.19 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.58 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  60.43 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.52 
 
 		 258 aa  251  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  59.83 
 
 		 231 aa  248  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  55.23 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  55.23 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  55.23 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  55.23 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  51.45 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  55.23 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  53.56 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  54.08 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  51.71 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  51.93 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.16 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  54.94 
 
 		 252 aa  228  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  50.86 
 
 		 230 aa  228  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.71 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  55 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  52.17 
 
 		 227 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  50.63 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.71 
 
 		 244 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  48.57 
 
 		 246 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.64 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.09 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  44.98 
 
 		 227 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 224 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 229 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  50.21 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  52.59 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  47.88 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>