More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3340 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.15 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  59.21 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.56 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.31 
 
 		 239 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  59.64 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 241 aa  255  6e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  58.22 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 239 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  55.98 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.97 
 
 		 239 aa  252  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  56.03 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.52 
 
 		 242 aa  251  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  56.44 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.39 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  54.77 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.26 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.7 
 
 		 273 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.52 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  53.5 
 
 		 406 aa  245  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  52.97 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  58.44 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  56.39 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  48.98 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  56.17 
 
 		 239 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  55.11 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 236 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  55.31 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  54.55 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.36 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  52.36 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  56.96 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  52.97 
 
 		 251 aa  236  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.41 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.84 
 
 		 238 aa  235  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.4 
 
 		 230 aa  234  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  49.79 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.98 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  47.08 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.51 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  57.08 
 
 		 250 aa  229  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  56 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 		 249 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 254 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  56.19 
 
 		 231 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.22 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  47.79 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.85 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.46 
 
 		 254 aa  202  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 248 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.41 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 227 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  43.75 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  40.6 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  40.6 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>