More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1098 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.82 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  59.01 
 
 		 227 aa  261  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 		 225 aa  255  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  56.7 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 		 228 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 		 231 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.91 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  56.44 
 
 		 231 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  59.19 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 224 aa  241  6e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  53.18 
 
 		 226 aa  238  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.48 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.91 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 233 aa  234  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  55.95 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  58.48 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  227  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 227 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.18 
 
 		 223 aa  222  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.65 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  56.19 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  47.51 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4346  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 384 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0299016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 246 aa  214  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  51.75 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 230 aa  211  4.9999999999999996e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.22 
 
 		 229 aa  211  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  47.73 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  43.61 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  45.78 
 
 		 236 aa  207  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 406 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.64 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  50.72 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.49 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  49.76 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 223 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  49.76 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  49.76 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  46.22 
 
 		 252 aa  201  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0640  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1991  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  44.89 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  44.29 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  43.84 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.89 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.89 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  49.05 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  47 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 255 aa  198  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.69 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  49.05 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1771  two component transcriptional regulator  44.98 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  47.77 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.69 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>