More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0354 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  78.17 
 
 		 229 aa  370  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  67.11 
 
 		 230 aa  304  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  63.72 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  58.87 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  61.14 
 
 		 229 aa  271  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.35 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  56 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  56.44 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  55.56 
 
 		 224 aa  251  6e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.81 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  53.33 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 227 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  51.54 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 219 aa  214  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  49.56 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  51.79 
 
 		 219 aa  204  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 224 aa  201  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 232 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 224 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.9 
 
 		 224 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1044  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.35 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00280  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.05 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000064956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.72 
 
 		 223 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.72 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.29 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  46.02 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6295  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.58 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.803537  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.85 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.85 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  45.73 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  43.56 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2768  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.29 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.29 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  42.92 
 
 		 223 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 227 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 246 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  44.98 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 232 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.74 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 406 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.11 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.11 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  43.95 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.44 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 273 aa  178  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.61 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.61 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.61 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.61 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.61 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.61 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.61 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 235 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 240 aa  178  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>