More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0759 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.11 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.09 
 
 		 228 aa  240  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 224 aa  235  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 225 aa  229  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 227 aa  228  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  53.25 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  221  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 229 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  49.34 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 240 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 226 aa  214  5.9999999999999996e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  48.65 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  46.19 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  47.51 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 406 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  47.09 
 
 		 252 aa  208  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  46.85 
 
 		 257 aa  207  7e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 224 aa  207  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  45.58 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 233 aa  205  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.4 
 
 		 225 aa  204  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.4 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  47.35 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.4 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  42.86 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  201  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50.69 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.43 
 
 		 271 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  43.11 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 222 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.05 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.3 
 
 		 236 aa  197  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.14 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.14 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  45.33 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.59 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6173  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.400074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4800  heavy metal response regulator  45.45 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2869  transcriptional activator protein IrlR  43.69 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1103  DNA-binding response regulator IrlR  43.69 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0630149  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2716  DNA-binding heavy metal response regulator  43.69 
 
 		 230 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.29 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.29 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>