More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2492 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  95.09 
 
 
224 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  94.2 
 
 
224 aa  428  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.61 
 
 
224 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 
228 aa  287  9e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1732  DNA-binding response regulator  59.65 
 
 
229 aa  270  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.019008  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  58.93 
 
 
230 aa  267  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  58.41 
 
 
229 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  56.44 
 
 
229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1398  DNA-binding response regulator  50.87 
 
 
246 aa  246  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000136334  hitchhiker  8.832960000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  53.78 
 
 
228 aa  240  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 
227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 
225 aa  238  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.36 
 
 
226 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 
219 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  51.34 
 
 
219 aa  238  5.999999999999999e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  51.79 
 
 
224 aa  236  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 
224 aa  236  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 
228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
236 aa  232  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1056  DNA-binding response regulator  54.02 
 
 
226 aa  232  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.775205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.36 
 
 
224 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
224 aa  228  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  50.89 
 
 
219 aa  221  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  48.21 
 
 
227 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  48.21 
 
 
227 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  48.21 
 
 
227 aa  211  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
230 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
230 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 
231 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 
230 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  47.77 
 
 
227 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 
228 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  49.1 
 
 
224 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1044  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.72 
 
 
234 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 
226 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 
231 aa  208  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 
224 aa  207  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 
223 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
224 aa  204  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00280  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  49.14 
 
 
234 aa  204  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000064956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  44.84 
 
 
230 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 
225 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
226 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
226 aa  201  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 
235 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 
225 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.13 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  45.05 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  44.59 
 
 
229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
406 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  43.5 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 
224 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 
231 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.59 
 
 
226 aa  198  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 
224 aa  198  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.5 
 
 
223 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 
273 aa  194  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 
225 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
223 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 
220 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 
224 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
233 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
238 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.64 
 
 
232 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 
236 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2268  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 
221 aa  193  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.56 
 
 
229 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 
226 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  46.4 
 
 
224 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 
231 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  40.51 
 
 
246 aa  191  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.59 
 
 
230 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 
224 aa  191  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 
224 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 
283 aa  191  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 
226 aa  191  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
223 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 
232 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.49 
 
 
232 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.05 
 
 
221 aa  191  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5235  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 
220 aa  191  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0048741  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 
231 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  45.92 
 
 
236 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 
224 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 
236 aa  190  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.24 
 
 
229 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 
231 aa  190  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.59 
 
 
226 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.132847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>