More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5009 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  98.28 
 
 		 231 aa  417  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  96.57 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  96.14 
 
 		 233 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  96.57 
 
 		 233 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  94.42 
 
 		 236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  63.91 
 
 		 248 aa  275  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  63.91 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 230 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  48.12 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  50 
 
 		 230 aa  209  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 224 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  47.14 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.58 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  45.69 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 406 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.65 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  46.93 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  48.91 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  52 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  50.22 
 
 		 229 aa  191  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  44.59 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.59 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.59 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  44.59 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  44.59 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  44.59 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  46.49 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  47.16 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  44.16 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  44.3 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 242 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.68 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.65 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  44.2 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  43.11 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.95 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  46.02 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.5 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  45.81 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  43.29 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.61 
 
 		 257 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  43.29 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  43.29 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 228 aa  184  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  45.33 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.05 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.33 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.55 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.05 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>