More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1377 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  60.44 
 
 		 226 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 228 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 231 aa  238  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  52.42 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.12 
 
 		 225 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 228 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  51.97 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  48.88 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.93 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 406 aa  208  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  46.85 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.95 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  54.26 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1228  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000325236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 225 aa  204  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 242 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  53.81 
 
 		 228 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 273 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  47.79 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  53.12 
 
 		 229 aa  201  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 242 aa  200  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.91 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  46.93 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  47.53 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  46.12 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.3 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  45.58 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  48.02 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  41.26 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.59 
 
 		 271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.75 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2158  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144347  normal  0.036827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.33 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  45.25 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 222 aa  194  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 225 aa  194  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 223 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 246 aa  194  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.53 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>