More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5089 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  51.53 
 
 		 237 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 243 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 243 aa  205  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 228 aa  204  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  48.88 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.52 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  48.29 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.79 
 
 		 229 aa  194  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  47.77 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 225 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  45.92 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 240 aa  185  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 406 aa  184  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.95 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5009  two component transcriptional regulator  51.43 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284196  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1744  two component transcriptional regulator  51.43 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4448  two component transcriptional regulator  51.43 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4535  two component transcriptional regulator  51.43 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4830  two component transcriptional regulator  51.43 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212021  normal  0.209649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10921  two component system response transcriptional regulatory protein prrA  51.43 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  39.55 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 219 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 229 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.18 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 224 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 224 aa  175  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 226 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  47.77 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.88 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  43.72 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  45.02 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  47.11 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  45.54 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.79 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 232 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 250 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>