More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1564 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  68.3 
 
 		 227 aa  292  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.44 
 
 		 228 aa  292  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  64.89 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  64.89 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  64.89 
 
 		 230 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  65.04 
 
 		 231 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  64.6 
 
 		 231 aa  280  9e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  64.89 
 
 		 230 aa  280  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.27 
 
 		 229 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  62.5 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.56 
 
 		 228 aa  264  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.91 
 
 		 223 aa  261  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  65.62 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.14 
 
 		 229 aa  258  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.71 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  61.67 
 
 		 237 aa  255  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  65.49 
 
 		 229 aa  255  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  64.89 
 
 		 228 aa  248  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  59.28 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.18 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.32 
 
 		 223 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 		 224 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.76 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  54.95 
 
 		 240 aa  238  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  55.91 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 226 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.45 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  54.3 
 
 		 224 aa  231  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.12 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.94 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  55.51 
 
 		 232 aa  224  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 224 aa  224  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  57.47 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  51.34 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.67 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  49.1 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  50.44 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.68 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.3 
 
 		 242 aa  218  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 406 aa  217  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 224 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  47.51 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 246 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  51.11 
 
 		 252 aa  214  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 283 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  50.22 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 235 aa  211  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 255 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 242 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  48 
 
 		 241 aa  208  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  55.75 
 
 		 238 aa  207  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  49.33 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.68 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.26 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.91 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.33 
 
 		 238 aa  205  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 241 aa  205  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.03 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  48.89 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  53.98 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  50.9 
 
 		 234 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>