More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4916 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.98 
 
 		 241 aa  288  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.95 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.29 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  66.07 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.04 
 
 		 239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.9 
 
 		 238 aa  279  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.43 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  62.28 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.11 
 
 		 239 aa  275  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.57 
 
 		 236 aa  275  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.41 
 
 		 243 aa  274  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 235 aa  274  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  60.35 
 
 		 233 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  60.35 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.23 
 
 		 236 aa  267  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.89 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.34 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  58.52 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  57.78 
 
 		 246 aa  262  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  60.35 
 
 		 248 aa  261  6e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.33 
 
 		 236 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  56.61 
 
 		 243 aa  260  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  58.8 
 
 		 234 aa  259  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  59.91 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  59.65 
 
 		 406 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.27 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  58.85 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  56.25 
 
 		 241 aa  255  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 270 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  58.41 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  57.71 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.73 
 
 		 273 aa  249  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.39 
 
 		 235 aa  248  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.83 
 
 		 237 aa  248  8e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  52.28 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  56.83 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  54.39 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.33 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.48 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  60.09 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 246 aa  234  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  58.37 
 
 		 231 aa  231  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  54.02 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  58.67 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.15 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.7 
 
 		 242 aa  224  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.56 
 
 		 243 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  50.44 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 231 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 249 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.11 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  50.22 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  48.67 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  49.35 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.23 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  49.78 
 
 		 232 aa  204  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 254 aa  200  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  51.56 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  52 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  48.47 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 224 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 224 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>