More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0274 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  58.22 
 
 		 227 aa  278  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.08 
 
 		 235 aa  278  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  55.56 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.77 
 
 		 225 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.67 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0453  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 225 aa  225  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.904663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  47.79 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.46 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  48.67 
 
 		 227 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2743  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 230 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 231 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  46.22 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 231 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 230 aa  207  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  44.49 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2944  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  0.70587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.17 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  43.91 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  42.67 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  44.54 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  43.11 
 
 		 226 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 406 aa  198  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.54 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.54 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  44.54 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.54 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.54 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.54 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.09 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3855  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.02 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  44.59 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.92 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.05 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.64 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.64 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 270 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  43.36 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.98 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 224 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.79 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  43.61 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  42.41 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  45.05 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  41.52 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  41.41 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>