More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5144 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  73.68 
 
 		 233 aa  343  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  76.21 
 
 		 235 aa  342  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  72.03 
 
 		 233 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.93 
 
 		 244 aa  338  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  73.13 
 
 		 234 aa  324  7e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.24 
 
 		 240 aa  314  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  70.67 
 
 		 234 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.94 
 
 		 239 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.68 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.32 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  62.5 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  60.34 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  63.95 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  62.11 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  67.12 
 
 		 229 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  62.11 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  62.11 
 
 		 239 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  65.49 
 
 		 236 aa  284  8e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  61.67 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  63.68 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  64.16 
 
 		 239 aa  282  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.07 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.37 
 
 		 239 aa  281  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.39 
 
 		 236 aa  277  9e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  59.46 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  57.38 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.33 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  58.41 
 
 		 241 aa  271  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.16 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  55.93 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.56 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  58.33 
 
 		 233 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  59.56 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 		 229 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  56.31 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  57.47 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.51 
 
 		 230 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.39 
 
 		 237 aa  248  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.01 
 
 		 271 aa  247  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.92 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  53.62 
 
 		 241 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 270 aa  241  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 406 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  54.02 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  56.76 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  56.76 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  54.46 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.31 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.51 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  54.05 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  56.11 
 
 		 231 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.3 
 
 		 242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  49.78 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  52.49 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.78 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.73 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  48.89 
 
 		 230 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45.42 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.93 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  194  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  44.4 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  44.4 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  44.84 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>