More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31480 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.12 
 
 		 243 aa  384  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.13 
 
 		 242 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.55 
 
 		 236 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.54 
 
 		 241 aa  349  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  74.15 
 
 		 239 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  74.68 
 
 		 236 aa  341  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.07 
 
 		 239 aa  339  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  69.71 
 
 		 243 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.15 
 
 		 236 aa  335  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  70.71 
 
 		 238 aa  332  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.06 
 
 		 239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  66.1 
 
 		 246 aa  322  2e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.49 
 
 		 240 aa  315  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  68.51 
 
 		 233 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  67.23 
 
 		 233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  68.07 
 
 		 235 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.95 
 
 		 244 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 		 239 aa  286  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 		 239 aa  286  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 		 239 aa  286  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  61.18 
 
 		 247 aa  284  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.68 
 
 		 236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  61.09 
 
 		 237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  65.67 
 
 		 234 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  60.17 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  61.02 
 
 		 236 aa  278  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  60.43 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  61.11 
 
 		 233 aa  275  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.68 
 
 		 235 aa  274  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  57.51 
 
 		 241 aa  271  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.83 
 
 		 271 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  63.25 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.54 
 
 		 231 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  59.57 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  59.57 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  57.39 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  57.26 
 
 		 229 aa  261  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.6 
 
 		 230 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  57.02 
 
 		 239 aa  257  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.88 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.02 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  57.39 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  56.77 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.6 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  54.13 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  59.05 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.52 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  55.23 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.52 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.9 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  57.46 
 
 		 286 aa  235  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  57.45 
 
 		 231 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  52.36 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.33 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  51.05 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  52.16 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  52.38 
 
 		 252 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  51.97 
 
 		 255 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.68 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.77 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  47.26 
 
 		 237 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  47.84 
 
 		 230 aa  207  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.52 
 
 		 244 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  47.21 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  46.78 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.57 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 234 aa  197  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.38 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.15 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  42.36 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 		 254 aa  191  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 235 aa  191  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>