More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8879 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  79.31 
 
 		 234 aa  357  8e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  76.21 
 
 		 233 aa  348  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.41 
 
 		 244 aa  348  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  75.77 
 
 		 233 aa  347  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.21 
 
 		 236 aa  342  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.05 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  67.69 
 
 		 247 aa  315  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  67.98 
 
 		 236 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  72.69 
 
 		 234 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  67.54 
 
 		 238 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  65.94 
 
 		 239 aa  308  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.08 
 
 		 243 aa  305  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.67 
 
 		 238 aa  305  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.83 
 
 		 239 aa  304  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  66.96 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.66 
 
 		 241 aa  296  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  67.98 
 
 		 236 aa  295  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  68.07 
 
 		 239 aa  296  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.51 
 
 		 242 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  67.39 
 
 		 239 aa  292  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  61.95 
 
 		 241 aa  292  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.44 
 
 		 235 aa  289  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.1 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  65.04 
 
 		 229 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  59.83 
 
 		 246 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  59.26 
 
 		 243 aa  279  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  57.61 
 
 		 246 aa  274  7e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 233 aa  274  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.96 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  61.3 
 
 		 237 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 229 aa  267  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.65 
 
 		 273 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.78 
 
 		 231 aa  266  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  57.46 
 
 		 248 aa  261  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  57.46 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  57.46 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  58.67 
 
 		 242 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.64 
 
 		 258 aa  258  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.52 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 		 406 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.71 
 
 		 237 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  57.27 
 
 		 251 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  57.78 
 
 		 270 aa  249  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  57.02 
 
 		 286 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  55.56 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.46 
 
 		 230 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  57.52 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.14 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.7 
 
 		 233 aa  235  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  55.26 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  57.4 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.01 
 
 		 241 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 246 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  54.39 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.84 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.87 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  48.7 
 
 		 257 aa  221  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 227 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.25 
 
 		 254 aa  211  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 231 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  47.58 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.3 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 224 aa  194  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 233 aa  195  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.3 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  45.69 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>