More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1724 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  75.64 
 
 		 236 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.37 
 
 		 273 aa  360  9e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  73.58 
 
 		 252 aa  358  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  77.19 
 
 		 406 aa  358  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  73.64 
 
 		 248 aa  352  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  71.91 
 
 		 271 aa  341  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.75 
 
 		 246 aa  339  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.25 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  74.79 
 
 		 250 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  73.47 
 
 		 254 aa  337  8e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  73.47 
 
 		 254 aa  337  8e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  73.47 
 
 		 254 aa  337  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  72.18 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  68.49 
 
 		 246 aa  334  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.1 
 
 		 242 aa  334  7.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  75.54 
 
 		 286 aa  333  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  73.57 
 
 		 231 aa  324  9e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  62.55 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  59.83 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  59.15 
 
 		 255 aa  277  9e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.32 
 
 		 244 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.8 
 
 		 248 aa  271  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.74 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.02 
 
 		 239 aa  266  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.62 
 
 		 236 aa  264  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.23 
 
 		 237 aa  262  4e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.54 
 
 		 239 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.76 
 
 		 231 aa  254  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  59.65 
 
 		 237 aa  251  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  57.02 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  56.58 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  54.36 
 
 		 247 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  56.64 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.39 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 242 aa  248  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 240 aa  248  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  54.35 
 
 		 236 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.19 
 
 		 238 aa  248  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.95 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  52.63 
 
 		 241 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.33 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.03 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.51 
 
 		 244 aa  244  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  59.56 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  55.84 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.51 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  57.21 
 
 		 234 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.31 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.28 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  52.36 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  51.07 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 270 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  49.34 
 
 		 231 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  50.67 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  48.89 
 
 		 241 aa  215  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 228 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  48.02 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  52.91 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.44 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.98 
 
 		 241 aa  207  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 		 227 aa  207  9e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.98 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.83 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>