More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1384 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  92.37 
 
 		 251 aa  450  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.39 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.44 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  56.25 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  56.7 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.83 
 
 		 239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  57.52 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.34 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  55.11 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.19 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  48.76 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.7 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.81 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.08 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  56.28 
 
 		 238 aa  235  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  54.31 
 
 		 237 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.79 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  56 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.09 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.02 
 
 		 231 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 239 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  47.52 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  54.88 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  55.51 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  55.84 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.94 
 
 		 242 aa  228  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.38 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.44 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.07 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.01 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.7 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  52.91 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  50 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 254 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 254 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 		 254 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 		 242 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  53.98 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  52.44 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  49.03 
 
 		 406 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  52 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  51.35 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  52.23 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.91 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  53.57 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  52 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  48.9 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.35 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.15 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.31 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.95 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2336  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  45.31 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.33 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.27 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0844  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000660959  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.81 
 
 		 233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  38.84 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.25 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 226 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 244 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>